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為提升疑似病例的確診效率,華為云做了這件事

2020-02-18 08:46:59   作者:   來(lái)源:CTI論壇   評(píng)論:0  點(diǎn)擊:


  華為云聯(lián)合希望組正式發(fā)布病毒基因組實(shí)時(shí)分析平臺(tái),該平臺(tái)覆蓋病毒樣本采集、病毒基因測(cè)序、數(shù)據(jù)傳輸、數(shù)據(jù)分析及展現(xiàn)全業(yè)務(wù)流程。(延伸閱讀:華為云推出新冠肺炎AI輔助診斷服務(wù),CT量化結(jié)果秒級(jí)輸出)

  與傳統(tǒng)方案相比,該平臺(tái)具有更便攜、檢測(cè)過(guò)程更快、更智能的優(yōu)勢(shì),適合于在大范圍內(nèi)同時(shí)開(kāi)展疫情的檢測(cè)工作,將極大提升疑似病例的確診效率,助力疫情防控。

  便攜

  單人可攜帶,隨時(shí)隨地進(jìn)行基因采樣、測(cè)序

  新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染的肺炎疫情暴發(fā)以來(lái),傳統(tǒng)試劑盒(熒光定量PCR核酸檢測(cè)試劑盒)在患者臨床診斷和疑似患者排查中發(fā)揮了重要作用, 但是該方法對(duì)檢測(cè)環(huán)境有嚴(yán)格要求:

  • 需要對(duì)樣本集中送檢,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)能力有限
  • 無(wú)法滿(mǎn)足當(dāng)前快速增長(zhǎng)的疑似患者的排查、診斷需求

  基于希望組的納米孔測(cè)序方案:

  使用小型化測(cè)序設(shè)備,單人即可攜帶,克服了場(chǎng)地限制,可以在各臨時(shí)醫(yī)療工作站、患者現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行基因采樣和測(cè)序,為患者確診提供快速檢測(cè)手段,縮短患者等待時(shí)間、緩解檢測(cè)壓力,有效抑制疫情的進(jìn)一步擴(kuò)散。(延伸閱讀:希望組宣布完成基于納米孔測(cè)技術(shù)的冠狀病毒測(cè)序試劑盒的研發(fā))

  實(shí)時(shí)

  5G網(wǎng)絡(luò)實(shí)時(shí)上傳數(shù)據(jù),快速完成病毒分析

  在沒(méi)有固定IT基礎(chǔ)設(shè)施的臨時(shí)醫(yī)療站,或缺少有線網(wǎng)絡(luò)和本地計(jì)算資源的工作點(diǎn),只能人工將采集的資源送遞到集中站點(diǎn)處理,時(shí)效性差。

  希望組與華為5G、華為云團(tuán)隊(duì)一起完成了實(shí)時(shí)機(jī)動(dòng)的測(cè)序數(shù)據(jù)上傳,并依托華為云基因容器的高性能:

  • 自動(dòng)化測(cè)序分析引擎和海量的計(jì)算資源
  • 病毒數(shù)據(jù)的遠(yuǎn)程上傳、分析,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的實(shí)時(shí)采集、實(shí)時(shí)分析、實(shí)時(shí)上報(bào)

  該方案能夠無(wú)縫擴(kuò)展到其他病原的檢測(cè)和監(jiān)測(cè),符合傳染性病原疫情的早發(fā)現(xiàn),早隔離,迅速切斷傳播路徑的防控理念。
 

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  智能

  檢測(cè)病毒基因組變異,精準(zhǔn)定位突變位點(diǎn)

  此外,對(duì)病毒基因組學(xué)和流行病學(xué)進(jìn)行實(shí)時(shí)和快速研究也是疫情防控中最重要也是容易缺失的一環(huán)。

  例如:

  截止到2月13日,全國(guó)確診陽(yáng)性患者達(dá)到59,000多例,但是全球所有新冠狀病毒的基因組數(shù)據(jù)卻只有87個(gè),這對(duì)全球了解新冠狀病毒的產(chǎn)生,傳播(包括時(shí)間和空間溯源),演化以及病毒毒力和感染力的研究造成了巨大的困難。

  而這些研究對(duì)于檢測(cè)方案的研發(fā),相應(yīng)疫苗和藥物研發(fā)具有重大意義,并且能夠?yàn)橐咔榉揽貨Q策提供科學(xué)支持,其和診斷治療同樣重要甚至更為重要。

  希望組基于ONT第三代測(cè)序技術(shù)結(jié)合華為云基因容器+AI容器的實(shí)時(shí)病毒基因組檢測(cè)平臺(tái)能夠在數(shù)小時(shí)之內(nèi)同時(shí)完成樣本檢測(cè)以及病毒基因組變異檢測(cè)。

  突破了包括實(shí)時(shí)熒光RT-PCR和傳統(tǒng)第二代測(cè)序技術(shù)在內(nèi)的現(xiàn)有檢測(cè)技術(shù)的局限以及對(duì)場(chǎng)地、外界環(huán)境的限制、提升了流程檢測(cè)的便攜性和測(cè)序效率,并推進(jìn)病毒檢測(cè)和基因組變異監(jiān)測(cè)工作全面下移,能夠更好地服務(wù)于新冠狀病毒的疫情防控,為廣大人民的健康保駕護(hù)航。

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