然而,基因測序工程,動輒需要數(shù)萬/數(shù)十萬個基因測序及模型建立,需要大量的計算和存儲資源,常見的基因轉換、拼接、對比、注釋全流程,用一臺高性能服務器運行耗時30多個小時,數(shù)萬乃至十萬級的基因測序任務,對網絡、存儲、算力,以及業(yè)務響應的及時性、可靠性、安全性有極高的要求。尤其是隨著第三代測序的推廣,在極大提升了測序準確性的同時,對計算資源也需求增長了數(shù)百倍,自建數(shù)據(jù)中心進行基因測序,在技術、建設周期和投資成本、運維成本上都面臨巨大的挑戰(zhàn)。
華為云容器批量計算 讓基因測序開足馬力
早在2018年,華為云就針對基因測序行業(yè)所面臨的困難,提供基于容器技術的解決方案,并發(fā)布了基因容器服務(Gene Container Service, GCS)。今年,綜合基因測序、AI、大數(shù)據(jù)、HPC等場景的共性訴求,華為云將基因容器全面升級容器批量計算服務(Batch Container Engine,BCE),為基因測序提供更高效、更易用、極致性價比的解決方案。
容器批量計算服務基于云容器引擎(CCE)、云容器實例(CCI)、智能邊緣平臺(IEF)等基礎設施,提供多集群、多任務/異構資源混合調度能力,并支持多隊列管理,讓多業(yè)務應用規(guī)劃更便捷。相比于傳統(tǒng)批量任務處理方案,容器批量計算服務在性能、調度、運維、成本等方面都具備明顯優(yōu)勢:
- 更高效 任務處理性能提升30%以上
面向容器/應用的調度算法優(yōu)化,TPC-DS測試較原生K8s效率提升30%以上,調度性能1000 PODs/秒 ,業(yè)界平均水平的十倍,同時支持跨Region進行資源調度,保障算力充足可用。
- 更易用 開箱即用免運維
通過自動統(tǒng)一的資源管理,屏蔽復雜的環(huán)境依賴,用戶不用考慮環(huán)境維護成本,僅需要將精力專注在應用本身,開箱即用,一處部署,處處可用。
- 極致性價比 實現(xiàn)性能與成本的最佳平衡
基于容器技術,提供秒級彈性伸縮能力,擴容速度可達30秒擴容8000核,在流量突增時能快速彈性擴容,保障業(yè)務的連續(xù)性和高穩(wěn)定性,通過按秒計費策略實現(xiàn)成本的精細化管理。
- 豐富的硬件生態(tài) 滿足不同場景的差異化算力訴求
容器批量計算支持 X86、鯤鵬、昇騰、GPU等多樣化算力集群的混合部署,結合業(yè)務特點,靈活分配資源,同時支持推理流量多種分發(fā)策略,可使綜合成本降低30%。
云原生高性能計算 行業(yè)客戶首選
基于容器批量計算,華為云還推出了云原生高性能計算解決方案,并與生物、醫(yī)療等各行業(yè)知名廠商合作,形成面向不同細化領域的行業(yè)化解決方案:
- 華大基因:云原生高性能計算解決方案為華大基因提供云端基因測序解決方案,通過對常用的軟件優(yōu)化,更好的支撐DNA、RNA、液態(tài)活檢等主流生物基因測序場景。
- 武漢希望組:利用三代測序優(yōu)勢,并采用5G傳輸、云原生高性能計算解決方案作為分析引擎和算力資源池,構建全流程的病毒基因組實時分析平臺,適合在大范圍內同時開展疫情的檢測工作。
- 金橡醫(yī)學:基于云原生高性能計算解決方案打造的全容器基因測序解決方案,使得將有限的資金實現(xiàn)最大化利用,助力金橡醫(yī)學在市場上占得先機。
- 上海生科院:VIC(Virus Identification Cloud)得到云原生高性能計算解決方案強大計算能力的支持,可提供高通量多樣本并行云端分析能力,助力臨床診斷,還可監(jiān)測病毒變異趨勢。
云原生高性能計算解決方案以應用為中心,并基于華為云擎天架構的深度軟硬協(xié)同能力,為業(yè)務提供多元算力、極致性能、極致體驗的云原生基礎設施,還再次升級了企業(yè)應用架構,統(tǒng)一企業(yè)在線與離線業(yè)務的運行平臺,簡化業(yè)務運維、提升資源利用率,進一步加速了企業(yè)業(yè)務敏捷創(chuàng)新,目前已經在AI、大數(shù)據(jù)、視頻轉碼等領域得到廣泛應用。