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核酸檢測數據都去哪兒了?

2021-06-23 13:44:18   作者:   來源:CTI論壇   評論:0  點擊:


  各街道社區(qū)核酸采樣點排長龍,忙碌但有條不紊。
  照嗓子眼那么一捅,24小時后看手機就行了,核酸檢測竟如此簡單?
  今天我們就講講核酸檢測如何做到如此快速且準確的。
  從喉嚨到手機,
  你的核酸檢測數據都經歷了什么?
  被“捅”了那一下之后,你便完成了核酸檢測的任務,而對于檢測整體流程來說,一切才剛剛開始……
  
  攜帶著細菌、病毒、上皮細胞的棉簽樣本被封存在試管中,并在第一時間送往檢測中心,核酸提取工作便迅速展開!
 
  檢測中心的工作人員通過引物與核酸之間的反應獲取檢測結果,生成的檢測結果會與你在排隊時被掃碼收集的個人信息通過人工搬運或拷貝等方式共同通過存儲采集至醫(yī)檢機構總部數據中臺。
  如果把視角放得更寬,目前個別地區(qū)依然存在疫情復發(fā)風險,各街道、社區(qū)設立的醫(yī)檢分支的核酸數據采集就已經是極為龐大的工作量!
  當核酸檢測數據采集完畢至數據中臺存儲后,工作人員需要通過存儲對新增的入庫數據進行監(jiān)控,并向數據中心推送數據新增清單,為下一步核酸檢測數據分析做準備。
  
  數據入庫以后,工作人員會對不同區(qū)域的核酸檢測數據進行分析。這個過程涉及對存儲頻繁的數據檢索與調用,對檢索效率有著極高的要求,檢索要敏捷,分析要迅速。醫(yī)檢機構會將個人核酸檢測報告發(fā)送給每個人,同時根據數據分析結果上報不同區(qū)域的疫情狀態(tài),對于疫情威脅采取相應措施。
  
  
  注意到了嗎?數據存儲貫穿了核酸數據的采集、入庫、分析的每一步,甚至可以說存儲對數據的收集能力、快速推送能力、檢索能力時刻影響著核酸檢測流程的整體效率!
  深信服助力核酸醫(yī)檢“新速度”
  新冠疫情讓更多人知道了新冠核酸檢測,但對于承擔檢測工作的機構卻了解甚少,事實上,除了各地疾控中心和醫(yī)院檢驗科,第三方醫(yī)學檢測機構也是提供新冠檢測服務的重要組成部分。
  從2020年初疫情爆發(fā),到如今的抗疫常態(tài)化,各大醫(yī)檢機構一直扮演著“逆行者”的角色,從各街道、社區(qū)的海量的核酸采樣、到快速檢測、數據入庫發(fā)布結果,醫(yī)檢工作人員通過無數個日夜的堅守,為人們提供快速便捷的服務,用一份又一份的核酸檢測報告給市民送去安心。
  在核酸快速檢測、強大的數據駕馭能力的背后,是深信服分布式存儲EDS的支撐。深信服EDS通過構建生物信息數據管理系統(tǒng),覆蓋海量醫(yī)檢數據采集、治理、檢索全流程,為某第三方醫(yī)檢機構的大數據平臺提供底層存儲能力支持。
  1.醫(yī)檢數據的自動化采集
  各醫(yī)檢分支機構數據采集流程安全可靠全自動化,從每日百GB的人工數據采集量提升到了“無窮大”,實現了RPA全自動化生物數據采集業(yè)務流程。
  某第三方醫(yī)檢分支機構通過使用EDS aDMT數據采集工具,將采集工具安裝在醫(yī)檢設備服務器上,完成采集策略配置后,當醫(yī)檢數據在本地服務器生成,采集工具的探針會感知數據的生成,數據生成結束會自動通過https加密協(xié)議將醫(yī)檢數據自動采集到總部實驗室的大數據對象存儲資源池。
  深信服研發(fā)團隊為了幫助分析師更好地完成數據采集,對aDMT在下載安裝、策略配置、一鍵采集等環(huán)節(jié)都做好了防護策略,并通過斷點續(xù)傳、服務器重啟aDMT自啟動等手段來滿足數據采集服務的長期穩(wěn)定運行,而不會影響醫(yī)學分析師的日常工作效率。
  2.提升醫(yī)檢數據入庫效率
  深信服EDS是一款遵循Low-code原則的智能化存儲平臺,可以根據用戶約定的數據格式和API規(guī)范,完成數字化訂閱。傳統(tǒng)的數據入庫是將非結構化數據通過采集、轉換、裝載,一條一條地插入到用戶的數據庫中,在這個過程中,需要監(jiān)控新增的數據增量變化情況,通過編寫監(jiān)控腳本完成數據變化的監(jiān)控,然后將新增的數據再通過編寫腳本完成數據、元數據信息的數據庫錄入。
  采用EDS Low-code的數字化訂閱服務,幫助醫(yī)檢中心的大數據分析師制定好API格式、字段后,EDS數字化訂閱服務會根據用戶的API字段將需要的數據信息提取出來,自動推送給大數據分析平臺,平臺接收到信號后會自動完成相關數據信息的數據庫入庫。
  相比傳統(tǒng)方式,EDS幫助大數據分析節(jié)省了無效的編碼工作,并且數據采集更加精確,根據實際統(tǒng)計EDS幫助該第三方醫(yī)檢機構提高了數據入庫效率,日數據治理量從每日1萬條提升到10萬條,開發(fā)部門對數據入庫和結構化的效率提高,整體業(yè)務流程更加順暢高效。
  3.全面提升數據檢索效率
  深信服EDS通過對象存儲數據管理平臺提供數據檢索服務,面對上億規(guī)模的醫(yī)檢非結構化數據,深信服利用自研Phxkv分布式數據庫,降低元數據在I/O路徑和資源等方面不必要的性能消耗與寫入次數,提升整體性能,輕松承載百億規(guī)模的元數據。
  在滿足百億級別元數據信息存儲的同時,所消耗的空間僅占常用960GB SSD的50%,精準合理的元數據編排規(guī)劃,能夠幫助管理員日檢索數據量從10條提升到“無窮條”,實現數據檢索0等待。
  后疫情時代,深信服分布式存儲EDS深耕醫(yī)檢大數據數字化場景, 將智能化的統(tǒng)一存儲能力以及便捷的數據管理服務幫助第三方醫(yī)檢機構構建醫(yī)檢大數據存儲底座,攜手提高醫(yī)檢大數據平臺的建設效率,共同造福于民。
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